Οι βάσεις για τη λειτουργία εθελοντικών ομάδων τίθενται το 1996, οι οποίες θα δρουν με αυτονομία η μία από την άλλη αλλά πάντα σε συνεργασία μεταξύ τους. Δημιουργούνται 14 ομάδες εργασίας: 1. Δράσης 2. Επαγγελματικής αποκατάστασης 3. Μελών 4. Εντευκτηρίου 5. Εύρεσης πόρων 6. Περιοδικού 7. Επικοινωνίας 8. Θεατρικού ομίλου 9. Θεοδωράκι 10. Σχολείου 11. Μουσικής αγωγής Το 1997 ο ΣΑΑΚ συνδράμει τον Τηλεμαραθώνιο του MEGA για τις οικονομικές ανάγκες της Εταιρείας Σπαστικών Ελλάδος, ενώ ξεκινά και μία μεγάλη προσπάθεια ενημέρωσης των αποφοίτων για τη δράση που θα μπορούσαν να αναπτύξουν στο πεδίο του εθελοντισμού. Το 1998 ομάδες αποφοίτων συμμετέχουν στον καθαρισμό της Νέας Παραλίας και στη δενδροφύτευση του Σέιχ Σου. Τον Απρίλιο του 1999 η Tipper Gore σύζυγος του αντιπροέδρου της κυβέρνησης των ΗΠΑ, Al Gore, επισκέπτεται το Κολλέγιο Ανατόλια και τη Θεσσαλονίκη, για να συμμετάσχει ως κεντρική ομιλήτρια στην εκδήλωση του ΣΑΑΚ με θέμα “Ο ρόλος του εθελοντισμού στην κάλυψη των κοινωνικών αναγκών”. Η εκδήλωση πραγματοποιείται με μεγάλη επιτυχία στο “Μακεδονία Παλλάς” και σε αυτήν παίρνουν μέρος ο Δημήτρης Πύρρος, ο Κώστας Καρράς και η Νίκη Τζαβέλα. Την ίδια χρονιά ο ΣΑΑΚ αναλαμβάνοντας μία ακόμη σημαντική πρωτοβουλία, κινητοποιεί μέλη του, που ανήκουν στην ιατρική κοινότητα, για τη στήριξη των ΚΕΦΟ (Κέντρα Φροντίδας Οικογένειας) στην περιοχή του Φοίνικα. Περισσότερα από 300 παιδιά εξετάζονται από πέντε ειδικότητες ιατρών, ενώ μία δεκαμελής ομάδα δραστηριοποιείται στο δημοτικό ίδρυμα “Άγιος Στυλιανός” και στους οικισμούς τσιγγάνων στη Χαλάστρα. Την ίδια χρονιά οργανώνεται το Συσσίτιο Υπερηλίκων στα ΚΕΦΟ του Φοίνικα, ενώ το 2001 ο Σύλλογος δίνει το παρών στο συνέδριο “Εθελοντισμός και Αθήνα 2004”, που πραγματοποιείται στο Μέγαρο Μουσικής Θεσσαλονίκης. Ο Σύλλογος Αποφοίτων διοργανώνει σε συνεργασία με το Γενικό Προξενείο των ΗΠΑ και το Ίδρυμα Fulbright εκδήλωση με θέμα “Αντιμετωπίζοντας τις Καταστροφές” (“Confronting Disaster”) με διακεκριμένους ομιλητές από την Ελλάδα και το εξωτερικό οι οποίοι υπογραμμίζουν το σημαντικό ρόλο του Εθελοντισμού. Επίσης ο Σύλλογος αποφασίζει την πραγματοποίηση του 1ου Διεθνούς Φεστιβάλ Χορωδιών στη Θεσσαλονίκη. Η Ομάδα Εθελοντισμού έρχεται σε επαφή με τη μη κυβερνητική οργάνωση “Κοινωνική Αλληλεγγύη” προκειμένου να οργανώσουν από κοινού δράσεις. Το Φεβρουάριο ο Σύλλογος Αποφοίτων και ο Αρμένικος Πολιτιστικός Σύλλογος “Χαμασκάιν” διοργανώνει στο Κολλέγιο εκδήλωση με θέμα “Αρμένιοι και Ανατόλια (1886 – 2002)”. Ο ΣΑΑΚ τιμά και τη Thea Halo συγγραφέα του βιβλίου “Ούτε το όνομα μου”, όπου μέσα από την αληθινή ζωή της μητέρας της Sano ξεδιπλώνεται η γενοκτονία των Ποντίων. Τον Μάιο, μέλη του ΣΑΑΚ και μαθητές του International Baccalaureate συμμετέχουν στο διεθνές πρόγραμμα “Clean up the Med” και καθαρίζουν την ακτή “Καβουρότρυπες” στη Σιθωνία Χαλκιδικής.